Анализ геномических данных в онкологии и иммунологии: инструменты для исследователей

Сайт представляет собой специализированный ресурс для научных исследований в области онкологии и иммунологии, сфокусированный на анализе геномных данных, включая данные из крупных международных проектов, таких как TCGA (The Cancer Genome Atlas), TARGET и GTEX.

Основная тематика сайта

Сайт посвящён глубокому анализу молекулярных данных в раковых заболеваниях и их взаимодействии с иммунной системой. Он предназначен для биологов, онкологов, биоинформатиков и исследователей, работающих в сфере персонализированной медицины, иммунотерапии и геномики.

Ключевые функции и инструменты

• T2 — интерактивный браузер данных TCGA 2018: позволяет просматривать и анализировать многослойные геномные данные, включая экспрессию РНК, мутации генов (.mut), позиционные мутации (.fmut), изменения числа копий генов (.cnv и .cnc), проекции сигнатур мутагенеза, классификацию подтипов опухолей, оценку чистоты опухоли и другие параметры. Инструмент также включает возможности корректировки данных с учётом технических смещений и ковариат.
• Faux Flow — визуализация одноклеточных данных: разработан для анализа данных одноклеточной РНК-секвенирования (single-cell RNA-seq) из исследований меланомы, гепатоцеллюлярного рака и моноцитов/дендритических клеток крови. Визуализатор моделирует поведение потоковой цитометрии, позволяя исследовать клеточные популяции по аналогии с реальными экспериментами, что улучшает интерпретацию сложных данных T-SNE или UMAP.
• Результаты браузера для GWAS-исследования: интегрированный инструмент для анализа результатов геномно-асоциативного исследования (GWAS) по взаимосвязи между генетикой опухолей и иммунным микросредой, основанный на работе Siemers et al. 2017 года.
• Единый браузер для TCGA, TARGET и GTEX: объединяет данные по раковым заболеваниям (взрослым и детям), а также нормальной ткани человека, обеспечивая возможность сравнительного анализа экспрессии РНК в разных условиях и типах тканей.
• AllNets — анализ сетевых взаимодействий генов: представляет собой инструмент для изучения связей между генами на основе межгенных сетей, построенных на данных TCGA. Позволяет выявлять ключевые гены, такие как CCR8, связаные с регуляторными Т-клетками в опухолевой среде, что имеет значение для разработки иммунотерапевтических стратегий.

Целевая аудитория

Сайт ориентирован на профессиональных исследователей: биоинформатиков, онкологов, иммунологов и клинических ученых, работающих над пониманием молекулярной природы рака, взаимодействия опухоли с иммунной системой, а также разработкой новых терапевтических подходов.

Инструменты сайта позволяют не только просматривать данные, но и проводить сложные аналитические операции, включая корректировку ковариат, построение сетевых моделей, интерпретацию одноклеточных профилей и поиск биомаркеров. Это делает ресурс незаменимым для современных исследований в области точной медицины.

            Domain Name: FIVEPRIME.ORG
Registrar: eNom, LLC
Domain Status: client transfer prohibited
Registry Expiry Date: 2028-12-26T02:00:14Z
Creation Date: 2002-12-26T02:00:14Z
Updated Date: 2025-12-09T20:32:55.299Z
Name Server: SUZANNE.NS.CLOUDFLARE.COM
Name Server: WEST.NS.CLOUDFLARE.COM
REGISTRAR Contact: eNom, LLC
>>> Last update of RDAP database: 2026-03-28T17:15:54Z         

Référencement technique

Référencement sur la page

Contenu et UX