PubMLST – nyílt adatbázisok a molekuláris tipizáláshoz és a mikrobiális diverzitás tanulmányozásához

PubMLST egy nemzetközi forrás, amely ingyenes hozzáférést biztosít a mikrobiális genomika nagy, lektorált adatbázisaihoz. Az oldal központi platformot biztosít több mint 140 baktériumfajra és nemzetségre vonatkozó adatok tárolására, elemzésére és megosztására, integrálva a génszekvenciákat, a molekuláris tipizálási profilokat, valamint az izolátumok eredetére és fenotípusára vonatkozó információkat.

Mitől egyedi a PubMLST?

A PubMLST abban különbözik a többi forrástól, hogy nem egyszerűen archiválja az adatokat, hanem szisztematikusan integrálja azokat a törzsek eredetére, a klinikai jellemzőkre és az epidemiológiai adatokra vonatkozó részletes információkkal. Ez lehetővé teszi a kutatók számára, hogy mélyreható elemzést végezzenek a fertőzések terjedésének dinamikájáról, azonosítsák a patogén leszármazásokat, és valós időben tanulmányozzák a mikroorganizmusok evolúcióját.

• Nagy mennyiségű adat:Ma több mint 44 millió allélt, 1,8 millió izolátumot és 1,3 millió teljes genomot tárolnak az adatbázisokban.
• Molekuláris gépelés támogatása: A platform eszközöket biztosít az MLST (Multi-Locus Sequence Typing) profilok és más gépelési módszerek meghatározásához.
• Fajazonosító eszközök: A felhasználók a riboszomális MLST segítségével pontosan azonosíthatják a baktérium faját annak genomiális szekvenciája alapján.

Fő munkaterületek

A PubMLST speciális adatbázisokat szervez a legfontosabb kórokozók számára, beleértve a következőket:

• Agyhártyagyulladással összefüggő kórokozók: Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, B csoportú streptococcusok (GBS).
• Szexuális fertőzések: Neisseria gonorrhoeae, Chlamydiales spp., Mycoplasma genitalium, Treponema pallidum.

Az oldal szorosan együttműködik más tudományos központokkal is, mint például a párizsi Institut Pasteur, amelyek ugyanazt a szoftverplatformot (BIGSdb) használják, amely egységes szabványt biztosít az adatfeldolgozáshoz nemzetközi szinten.

Hogyan lehet részt venni?

A PubMLST aktívan meghívja a tudósokat és laboratóriumokat, hogy vegyenek részt az adatgyűjtésben. A kutatók benyújthatják adataikat allélként, MLST-profilként vagy teljes izolátumként – genomi információval vagy anélkül. Ez hozzájárul az adatmennyiség növekedéséhez és az elemzések pontosságának növeléséhez globális szinten.

Adatlinkek és hivatkozások

A PubMLST-ből származó adatok helyes felhasználásához javasoljuk, hogy olvassa elJolley et al. 2018megjelent: Wellcome Open Research. Ez fontos az akadémiai integritás és a tudományos közösség fenntartása szempontjából.

Kapcsolatfelvételi adatok

Kapcsolatfelvétel: Vegye fel a kapcsolatot a PubMLST csapatával, ha megjegyzéseket, javaslatokat vagy kérdéseket szeretne tenni a webhellyel és az adatbázisokkal kapcsolatban.

Idézet: Jolley et al. 2018 Wellcome Open Res 3:124

Támogatás: Az Institut Pasteur (Párizs) partner a BIGSdb platform fejlesztésében, amelyet mind a PubMLST-n, mind a saját szervereiken használnak.

Webhelyfejlesztés: Manta Ray Media

• charset: utf-8
• name: description content: A collection of open-access, curated databases that integrate population sequence data with provenance and phenotype information for over 100 different microbial species and genera.
• name: rights content: Manta Ray Media & PubMLST
• property: og:site_name content: PubMLST
• property: og:type content: Home
• property: og:title content: PubMLST - Public databases for molecular typing and microbial genome diversity
• name: twitter:card content: summary
• name: twitter:title content: PubMLST
• name: twitter:site content: @PubMLST
• name: twitter:description content: Public databases for molecular typing and microbial genome diversity
• name: twitter:image content: http://pubmlst.org/sites/default/files/content/cards/images/2020-08/rMLST_sunburst.png
• name: Generator content: Drupal 10 (https://www.drupal.org)
• name: MobileOptimized content: width
• name: HandheldFriendly content: true
• name: viewport content: width=device-width, initial-scale=1, shrink-to-fit=no
• equiv: x-ua-compatible content: ie=edge
• name: msapplication-TileColor content: #193658
• name: theme-color content: #002147

• Skip to main content
• My Account
• Home
• http://pubmlst.org/organisms
• http://pubmlst.org/species-id
• About us
• Updates
• http://pubmlst.org/site-accounts
• http://pubmlst.org/submit-data
• http://pubmlst.org/projects/gmgl
• http://pubmlst.org/sti
• Get in touch with us
• https://bsky.app/profile/pubmlst.org
• Disclaimer & Privacy
• Cookies
• Terms & Conditions

• https://bigsdb.pasteur.fr/
• Jolley 
• https://www.youtube.com/@pubmlst
• https://wellcome.ac.uk/
• Manta Ray Media

            Domain Name: PUBMLST.ORG
Registrar: Easyspace Limited
Domain Status: client transfer prohibited
Domain Status: client update prohibited
Registry Expiry Date: 2033-08-04T15:57:11.981Z
Creation Date: 2003-08-04T15:57:11.981Z
Updated Date: 2023-08-12T08:00:23.113Z
Name Server: DNS0.OX.AC.UK
Name Server: DNS2.OX.AC.UK
REGISTRAR Contact: Easyspace Limited
>>> Last update of RDAP database: 2026-05-19T23:21:57Z         

			#
# robots.txt
#
# This file is to prevent the crawling and indexing of certain parts
# of your site by web crawlers and spiders run by sites like Yahoo!
# and Google. By telling these "robots" where not to go on your site,
# you save bandwidth and server resources.
#
# This file will be ignored unless it is at the root of your host:
# Used:    http://example.com/robots.txt
# Ignored: http://example.com/site/robots.txt
#
# For more information about the robots.txt standard, see:
# http://www.robotstxt.org/robotstxt.html

User-agent: *
# CSS, JS, Images
Allow: /core/*.css$
Allow: /core/*.css?
Allow: /core/*.js$
Allow: /core/*.js?
Allow: /core/*.gif
Allow: /core/*.jpg
Allow: /core/*.jpeg
Allow: /core/*.png
Allow: /core/*.svg
Allow: /profiles/*.css$
Allow: /profiles/*.css?
Allow: /profiles/*.js$
Allow: /profiles/*.js?
Allow: /profiles/*.gif
Allow: /profiles/*.jpg
Allow: /profiles/*.jpeg
Allow: /profiles/*.png
Allow: /profiles/*.svg
# Directories
Disallow: /core/
Disallow: /profiles/
Disallow: /cgi-bin/
# Files
Disallow: /static/data.html
Disallow: /README.txt
Disallow: /web.config
Disallow: /bigsdb
Disallow: /bigsdb.pl
# Paths (clean URLs)
Disallow: /admin/
Disallow: /comment/reply/
Disallow: /filter/tips
Disallow: /node/add/
Disallow: /search/
Disallow: /user/register
Disallow: /user/password
Disallow: /user/login
Disallow: /user/logout
Disallow: /media/oembed
Disallow: /*/media/oembed
# Paths (no clean URLs)
Disallow: /index.php/admin/
Disallow: /index.php/comment/reply/
Disallow: /index.php/filter/tips
Disallow: /index.php/node/add/
Disallow: /index.php/search/
Disallow: /index.php/user/password
Disallow: /index.php/user/register
Disallow: /index.php/user/login
Disallow: /index.php/user/logout
Disallow: /index.php/media/oembed
Disallow: /index.php/*/media/oembed
        

Technikai SEO

On-Page SEO

Tartalom és UX